Dobrý deň,
podľa zákona o vysokých školách do kompetencie fakulty patria uzatváranie, zmeny a zrušovanie pracovnoprávnych vzťahov v rozsahu a za podmienok určených v štatúte verejnej vysokej školy. Pokiaľ štatút umožňuje konať samostatne, tak potom by ste podľa môjho názoru mohli konať aj samostatne. To je potrebné však overiť. Bez podrobnejšieho skúmania problému, to nie je možné takto povedať.
Nemôžete určite urobiť to, že dohodnete pracovný pomer na dobu určitú a potom hneď nový pracovný pomer na dobu určitú. Išlo by o opätovne uzavretý pracovný pomer na dobu určitú. Opätovne dohodnutý pracovný pomer na určitú dobu je pracovný pomer, ktorý má vzniknúť pred uplynutím šiestich mesiacov po skončení predchádzajúceho pracovného pomeru na určitú dobu medzi tými istými účastníkmi.
Aj na túto situáciu by sa vzťahovala podmienka predĺženia / opätovného uzavretia v období 2 rokov max. 2 krát, ak nejde o výnimky podľa § 48 ods. 4 Zákonníka práce.
Odporúčam preto pozrieť kompetencie fakulty, či môže konať v rozpore s pokynom rektora. Ak áno, tak potom uzavrieť prac. pomer na dobu neurčitú. Je to však komplexná otázka, ktorú by bolo potrebné podrobnejšie preskúmať.